Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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COL19A1Q14993 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
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COL19A1Q14993 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
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COL19A1Q14993 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
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COL19A1Q14993 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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COL19A1Q14993 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
COL19A1Q14993 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
COL19A1Q14993 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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