Protein–RNA interactions for Protein: Q13454

TUSC3, Tumor suppressor candidate 3, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC3Q13454 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TUSC3Q13454 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TUSC3Q13454 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.8 ms