Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HOXC10Q9NYD6 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXC10Q9NYD6 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXC10Q9NYD6 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXC10Q9NYD6 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXC10Q9NYD6 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXC10Q9NYD6 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXC10Q9NYD6 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXC10Q9NYD6 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXC10Q9NYD6 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXC10Q9NYD6 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXC10Q9NYD6 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXC10Q9NYD6 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXC10Q9NYD6 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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HOXC10Q9NYD6 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXC10Q9NYD6 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXC10Q9NYD6 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HOXC10Q9NYD6 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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HOXC10Q9NYD6 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
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HOXC10Q9NYD6 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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HOXC10Q9NYD6 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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HOXC10Q9NYD6 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
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HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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HOXC10Q9NYD6 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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HOXC10Q9NYD6 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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