Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP30Q70CQ3 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
USP30Q70CQ3 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms