Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
TPRNQ4KMQ1 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TPRNQ4KMQ1 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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