Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
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BRD3Q15059 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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BRD3Q15059 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
BRD3Q15059 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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BRD3Q15059 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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BRD3Q15059 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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BRD3Q15059 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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BRD3Q15059 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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BRD3Q15059 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
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