Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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TUBA3CQ13748 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
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TUBA3CQ13748 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
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TUBA3CQ13748 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
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TUBA3CQ13748 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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TUBA3CQ13748 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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TUBA3CQ13748 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
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TUBA3CQ13748 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
TUBA3CQ13748 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
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