Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
MKRN4PQ13434 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MKRN4PQ13434 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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