Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD11P31277 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXD11P31277 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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