Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK4Q16099 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK4Q16099 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK4Q16099 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK4Q16099 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK4Q16099 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK4Q16099 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK4Q16099 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK4Q16099 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK4Q16099 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK4Q16099 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK4Q16099 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK4Q16099 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK4Q16099 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK4Q16099 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK4Q16099 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK4Q16099 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK4Q16099 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK4Q16099 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK4Q16099 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK4Q16099 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK4Q16099 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK4Q16099 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK4Q16099 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK4Q16099 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK4Q16099 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK4Q16099 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK4Q16099 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK4Q16099 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK4Q16099 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK4Q16099 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK4Q16099 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK4Q16099 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms