Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF1Q15637 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF1Q15637 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF1Q15637 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF1Q15637 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF1Q15637 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF1Q15637 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF1Q15637 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF1Q15637 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF1Q15637 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF1Q15637 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF1Q15637 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SF1Q15637 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF1Q15637 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF1Q15637 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF1Q15637 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF1Q15637 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SF1Q15637 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SF1Q15637 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SF1Q15637 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SF1Q15637 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SF1Q15637 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF1Q15637 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SF1Q15637 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF1Q15637 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF1Q15637 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF1Q15637 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF1Q15637 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SF1Q15637 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF1Q15637 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF1Q15637 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF1Q15637 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF1Q15637 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SF1Q15637 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SF1Q15637 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SF1Q15637 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SF1Q15637 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SF1Q15637 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SF1Q15637 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SF1Q15637 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SF1Q15637 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SF1Q15637 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SF1Q15637 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF1Q15637 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF1Q15637 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF1Q15637 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF1Q15637 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF1Q15637 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF1Q15637 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF1Q15637 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF1Q15637 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF1Q15637 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SF1Q15637 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SF1Q15637 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF1Q15637 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF1Q15637 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF1Q15637 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SF1Q15637 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF1Q15637 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF1Q15637 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF1Q15637 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF1Q15637 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF1Q15637 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF1Q15637 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF1Q15637 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF1Q15637 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SF1Q15637 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF1Q15637 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF1Q15637 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SF1Q15637 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SF1Q15637 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SF1Q15637 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SF1Q15637 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF1Q15637 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SF1Q15637 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SF1Q15637 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF1Q15637 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF1Q15637 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF1Q15637 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF1Q15637 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF1Q15637 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF1Q15637 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF1Q15637 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF1Q15637 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SF1Q15637 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF1Q15637 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF1Q15637 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SF1Q15637 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF1Q15637 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF1Q15637 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SF1Q15637 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SF1Q15637 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SF1Q15637 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SF1Q15637 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SF1Q15637 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SF1Q15637 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SF1Q15637 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SF1Q15637 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SF1Q15637 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SF1Q15637 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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