Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NFIXQ14938 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NFIXQ14938 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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