Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD9Q14511 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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