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| NCOA4 | Q13772 | AL365205.2-201 | ENST00000594586 | 68 nt | BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| NCOA4 | Q13772 | AL359075.3-201 | ENST00000613288 | 217 nt | BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
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| NCOA4 | Q13772 | TOP2A-201 | ENST00000423485 | 5758 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| NCOA4 | Q13772 | SYNE1-212 | ENST00000423061 | 27436 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| NCOA4 | Q13772 | SLC39A10-202 | ENST00000409086 | 5432 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
| NCOA4 | Q13772 | Y_RNA.66-201 | ENST00000362862 | 102 nt | BASIC | 3.59 | □□□□□ -1.83 | | |
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| NCOA4 | Q13772 | 5S_rRNA.12-201 | ENST00000617631 | 107 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| NCOA4 | Q13772 | MIR6079-201 | ENST00000635807 | 62 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
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| NCOA4 | Q13772 | MBNL3-204 | ENST00000370853 | 2661 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| NCOA4 | Q13772 | ADGRV1-201 | ENST00000405460 | 19557 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| NCOA4 | Q13772 | Z83843.1-201 | ENST00000604070 | 3685 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| NCOA4 | Q13772 | PTBP2-211 | ENST00000609116 | 12014 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| NCOA4 | Q13772 | RTTN-201 | ENST00000255674 | 6960 nt | TSL 5 BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| NCOA4 | Q13772 | PHTF2-201 | ENST00000248550 | 4778 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| NCOA4 | Q13772 | PRKD3-202 | ENST00000379066 | 6111 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| NCOA4 | Q13772 | NBPF20-201 | ENST00000369373 | 18760 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| NCOA4 | Q13772 | DICER1-203 | ENST00000526495 | 10331 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| NCOA4 | Q13772 | CCDC30-201 | ENST00000340612 | 2664 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| NCOA4 | Q13772 | RNU1-70P-201 | ENST00000362618 | 164 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| NCOA4 | Q13772 | EPS15-202 | ENST00000371730 | 4736 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| NCOA4 | Q13772 | RNY4P18-201 | ENST00000391107 | 89 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| NCOA4 | Q13772 | AL135790.1-201 | ENST00000427161 | 157 nt | TSL 3 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| NCOA4 | Q13772 | AC018634.1-201 | ENST00000437554 | 401 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| NCOA4 | Q13772 | PRSS3P4-201 | ENST00000453323 | 162 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| NCOA4 | Q13772 | AC018868.1-201 | ENST00000491307 | 315 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |