Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.93
SMAD4Q13485 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SMAD4Q13485 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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