Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3FQ13275 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3FQ13275 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3FQ13275 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3FQ13275 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3FQ13275 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3FQ13275 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3FQ13275 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3FQ13275 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3FQ13275 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SEMA3FQ13275 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3FQ13275 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3FQ13275 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3FQ13275 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3FQ13275 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3FQ13275 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3FQ13275 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3FQ13275 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3FQ13275 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3FQ13275 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3FQ13275 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3FQ13275 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SEMA3FQ13275 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SEMA3FQ13275 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SEMA3FQ13275 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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