Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
MSRB1Q9NZV6 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
MSRB1Q9NZV6 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms