Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SEC23AQ15436 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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SEC23AQ15436 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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SEC23AQ15436 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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SEC23AQ15436 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEC23AQ15436 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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