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| NAE1 | Q13564 | snoU2-30.2-201 | ENST00000362805 | 70 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.230-201 | ENST00000364348 | 109 nt | BASIC | 1.96 | □□□□□ -2.1 | | |
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| NAE1 | Q13564 | AC007742.2-201 | ENST00000618226 | 398 nt | BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
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| NAE1 | Q13564 | SYT14-201 | ENST00000367015 | 5094 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 1.93 | □□□□□ -2.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | OXR1-209 | ENST00000517566 | 4501 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | SCN7A-206 | ENST00000619410 | 7186 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | SCN7A-207 | ENST00000621965 | 7186 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.153-201 | ENST00000363615 | 91 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.183-201 | ENST00000363882 | 113 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-1175P-201 | ENST00000365200 | 107 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | SNORA20B-201 | ENST00000384220 | 132 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
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| NAE1 | Q13564 | RNU6-937P-201 | ENST00000384325 | 106 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
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| NAE1 | Q13564 | RNU2-54P-201 | ENST00000410299 | 190 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU2-2P-201 | ENST00000410396 | 191 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU2-20P-201 | ENST00000410425 | 191 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-1199P-201 | ENST00000411249 | 104 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL513185.1-201 | ENST00000431638 | 162 nt | TSL 5 BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC073910.1-201 | ENST00000445047 | 438 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
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| NAE1 | Q13564 | AC090398.1-202 | ENST00000580403 | 457 nt | TSL 2 BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
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| NAE1 | Q13564 | hsa-mir-3158-1.1-201 | ENST00000637571 | 81 nt | BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |
| NAE1 | Q13564 | SIRT1-203 | ENST00000406900 | 3295 nt | TSL 2 BASIC | 1.92 | □□□□□ -2.1 | | |