| FLII | Q13045 | RNA5SP341-201 | ENST00000516261 | 117 nt | BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-346P-201 | ENST00000516288 | 111 nt | BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | AC087362.2-201 | ENST00000529325 | 256 nt | TSL 3 BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | U7.8-201 | ENST00000619968 | 63 nt | BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | GABRG2-215 | ENST00000639213 | 9960 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | SLC39A10-202 | ENST00000409086 | 5432 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.95 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | TBC1D31-214 | ENST00000522420 | 3167 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | KIAA1109-203 | ENST00000388738 | 15574 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD15B-201 | ENST00000384714 | 146 nt | BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | MT-TT-201 | ENST00000387460 | 66 nt | BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
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| FLII | Q13045 | AL121914.1-201 | ENST00000450188 | 156 nt | BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
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| FLII | Q13045 | RNU6-1041P-201 | ENST00000516254 | 102 nt | BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
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| FLII | Q13045 | PPIP5K2-203 | ENST00000414217 | 5842 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.94 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | AL355596.1-201 | ENST00000565399 | 3996 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | MIR422A-201 | ENST00000362286 | 90 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.99-201 | ENST00000363138 | 105 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-449P-201 | ENST00000383914 | 107 nt | BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
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| FLII | Q13045 | SLCO1B3-201 | ENST00000261196 | 2840 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | PRKACB-217 | ENST00000610457 | 4206 nt | TSL 2 BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | DICER1-203 | ENST00000526495 | 10331 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | CNOT6L-201 | ENST00000504123 | 8843 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.93 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | AC093010.3-201 | ENST00000570269 | 15214 nt | BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | DDX60L-207 | ENST00000505890 | 4568 nt | TSL 2 BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | AC073325.2-201 | ENST00000339545 | 159 nt | BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | snoU2-30.2-201 | ENST00000362805 | 70 nt | BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | RNU4-84P-201 | ENST00000364200 | 139 nt | BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | RNU4-41P-201 | ENST00000364426 | 143 nt | BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | RNY1P5-201 | ENST00000383890 | 115 nt | BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | AL606845.1-201 | ENST00000404881 | 255 nt | BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | AC116666.1-201 | ENST00000453915 | 551 nt | TSL 5 BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | S100A11P2-201 | ENST00000467589 | 312 nt | BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | NDUFA5P6-201 | ENST00000542110 | 379 nt | BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | AC023490.3-201 | ENST00000621762 | 358 nt | TSL 3 BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | AP000550.4-201 | ENST00000639507 | 358 nt | TSL 3 BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | PALMD-205 | ENST00000615664 | 1844 nt | TSL 5 BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | LEPR-202 | ENST00000349533 | 8227 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | MARCH7-202 | ENST00000409175 | 2402 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | SIRT1-202 | ENST00000403579 | 3333 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.92 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-1130P-201 | ENST00000365434 | 107 nt | BASIC | 3.91 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | SNORA72-201 | ENST00000384339 | 132 nt | BASIC | 3.91 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-160P-201 | ENST00000384591 | 107 nt | BASIC | 3.91 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-1072P-201 | ENST00000384703 | 107 nt | BASIC | 3.91 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-443P-201 | ENST00000384780 | 107 nt | BASIC | 3.91 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | EDDM3CP-201 | ENST00000415977 | 425 nt | BASIC | 3.91 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | AL445490.2-201 | ENST00000440492 | 441 nt | TSL 3 BASIC | 3.91 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | RNA5SP217-201 | ENST00000515959 | 91 nt | BASIC | 3.91 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | MIR4431-201 | ENST00000579990 | 94 nt | BASIC | 3.91 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | AL162274.2-201 | ENST00000614406 | 332 nt | BASIC | 3.91 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | SKIL-202 | ENST00000413427 | 2702 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | TFEC-201 | ENST00000265440 | 6628 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.78 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD56.3-201 | ENST00000363507 | 71 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-1228P-201 | ENST00000391014 | 107 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | AL512604.1-201 | ENST00000404812 | 257 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | RPS15AP28-201 | ENST00000435088 | 386 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | RN7SL442P-201 | ENST00000473804 | 320 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | SNORA64.4-201 | ENST00000516632 | 81 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | AC024270.4-201 | ENST00000570202 | 421 nt | TSL 3 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | LARP7P3-201 | ENST00000579888 | 337 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | AC007229.1-201 | ENST00000590455 | 412 nt | BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | NOX4-202 | ENST00000343727 | 3347 nt | TSL 2 BASIC | 3.9 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | OR5V1-217 | ENST00000641768 | 2763 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | TRDN-201 | ENST00000334268 | 4770 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | MIR22-201 | ENST00000362190 | 85 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-239P-201 | ENST00000390990 | 99 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.580-201 | ENST00000391004 | 95 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | AC245102.2-201 | ENST00000448956 | 180 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | AC107027.2-201 | ENST00000512197 | 115 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-406P-201 | ENST00000516470 | 107 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | RN7SKP282-201 | ENST00000516824 | 299 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | AC138625.2-201 | ENST00000563968 | 551 nt | TSL 3 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | AC073413.2-201 | ENST00000604332 | 360 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | U2.22-201 | ENST00000636441 | 106 nt | BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | KTN1-203 | ENST00000395309 | 4021 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | CFH-202 | ENST00000367429 | 4127 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.89 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | CCDC168-201 | ENST00000322527 | 21466 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | HDX-206 | ENST00000506585 | 6158 nt | TSL 2 BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | LRRTM2-201 | ENST00000274711 | 6017 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-728P-201 | ENST00000365375 | 104 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | MIR1262-201 | ENST00000408276 | 93 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.621-201 | ENST00000411065 | 96 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | Z92545.1-201 | ENST00000411782 | 234 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | RPS4XP11-201 | ENST00000446897 | 772 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | LINC01203-202 | ENST00000456091 | 476 nt | TSL 3 BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | AC026271.5-201 | ENST00000577873 | 130 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | MIR3910-1-201 | ENST00000580936 | 111 nt | BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | CUL3-204 | ENST00000409777 | 3147 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.88 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | SEMA3D-201 | ENST00000284136 | 6265 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.87 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | GRAMD1C-202 | ENST00000440446 | 3475 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.87 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD115-3-201 | ENST00000363100 | 82 nt | BASIC | 3.87 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD114-6-201 | ENST00000364393 | 72 nt | BASIC | 3.87 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | RNU1-91P-201 | ENST00000364746 | 163 nt | BASIC | 3.87 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | MIR15B-201 | ENST00000385045 | 98 nt | BASIC | 3.87 | □□□□□ -1.79 | | |
| FLII | Q13045 | RNU11-5P-201 | ENST00000391216 | 129 nt | BASIC | 3.87 | □□□□□ -1.79 | | |