Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
FOXF2Q12947 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXF2Q12947 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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