Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CDO1Q16878 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CDO1Q16878 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.8 ms