Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
E2F4Q16254 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
E2F4Q16254 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
E2F4Q16254 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
E2F4Q16254 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
E2F4Q16254 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
E2F4Q16254 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
E2F4Q16254 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
E2F4Q16254 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
E2F4Q16254 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
E2F4Q16254 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
E2F4Q16254 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
E2F4Q16254 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
E2F4Q16254 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
E2F4Q16254 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
E2F4Q16254 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
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