Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NKX1-1Q15270 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NKX1-1Q15270 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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