Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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SCARB2Q14108 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SCARB2Q14108 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SCARB2Q14108 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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