Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTGDRQ13258 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTGDRQ13258 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
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