Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.6 ms