Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FAM53CQ9NYF3 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.3 ms