Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HIF1AQ16665 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms