Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
GRIK4Q16099 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms