Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
TAF1CQ15572 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms