Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHBQ15464 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHBQ15464 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHBQ15464 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHBQ15464 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHBQ15464 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHBQ15464 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHBQ15464 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHBQ15464 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHBQ15464 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHBQ15464 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHBQ15464 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHBQ15464 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHBQ15464 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHBQ15464 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHBQ15464 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHBQ15464 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHBQ15464 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHBQ15464 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHBQ15464 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHBQ15464 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHBQ15464 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHBQ15464 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHBQ15464 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHBQ15464 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHBQ15464 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHBQ15464 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHBQ15464 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHBQ15464 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHBQ15464 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHBQ15464 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHBQ15464 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHBQ15464 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHBQ15464 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHBQ15464 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHBQ15464 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHBQ15464 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHBQ15464 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHBQ15464 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHBQ15464 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHBQ15464 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHBQ15464 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHBQ15464 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SHBQ15464 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SHBQ15464 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SHBQ15464 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SHBQ15464 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHBQ15464 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHBQ15464 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHBQ15464 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHBQ15464 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHBQ15464 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHBQ15464 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SHBQ15464 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHBQ15464 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SHBQ15464 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SHBQ15464 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SHBQ15464 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SHBQ15464 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SHBQ15464 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
SHBQ15464 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHBQ15464 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SHBQ15464 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SHBQ15464 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHBQ15464 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHBQ15464 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHBQ15464 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHBQ15464 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHBQ15464 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHBQ15464 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SHBQ15464 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHBQ15464 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHBQ15464 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHBQ15464 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHBQ15464 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHBQ15464 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHBQ15464 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHBQ15464 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHBQ15464 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHBQ15464 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHBQ15464 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHBQ15464 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SHBQ15464 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHBQ15464 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHBQ15464 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHBQ15464 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHBQ15464 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHBQ15464 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHBQ15464 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHBQ15464 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHBQ15464 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHBQ15464 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHBQ15464 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHBQ15464 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHBQ15464 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHBQ15464 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHBQ15464 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SHBQ15464 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHBQ15464 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SHBQ15464 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms