Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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SEMA3FQ13275 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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SEMA3FQ13275 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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SEMA3FQ13275 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
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