Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
NFIAQ12857 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NFIAQ12857 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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