Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
HOXD11P31277 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
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