Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
RABGEF1Q9UJ41 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
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RABGEF1Q9UJ41 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
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RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
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RABGEF1Q9UJ41 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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RABGEF1Q9UJ41 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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RABGEF1Q9UJ41 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1Q9UJ41 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
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