Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
RTN1Q16799 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RTN1Q16799 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RTN1Q16799 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RTN1Q16799 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RTN1Q16799 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RTN1Q16799 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RTN1Q16799 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RTN1Q16799 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RTN1Q16799 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RTN1Q16799 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RTN1Q16799 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RTN1Q16799 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RTN1Q16799 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
RTN1Q16799 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RTN1Q16799 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
RTN1Q16799 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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RTN1Q16799 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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RTN1Q16799 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
RTN1Q16799 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
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