Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
LSAMPQ13449 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LSAMPQ13449 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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