Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CALCOCO2Q13137 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CALCOCO2Q13137 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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