Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
HOXD11P31277 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
HOXD11P31277 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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