Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PIAS3Q9Y6X2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIAS3Q9Y6X2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIAS3Q9Y6X2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIAS3Q9Y6X2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIAS3Q9Y6X2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PIAS3Q9Y6X2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIAS3Q9Y6X2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms