Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms