Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG6Q9Y2V7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms