Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PNMA8BQ9ULN7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms