Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms