Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MSRAQ9UJ68 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms