Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCF2Q9UG63 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCF2Q9UG63 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms