Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
IFT172Q9UG01 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IFT172Q9UG01 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms