Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHL9Q9P2J3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLHL9Q9P2J3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms