Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C9orf78Q9NZ63 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C9orf78Q9NZ63 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C9orf78Q9NZ63 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C9orf78Q9NZ63 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C9orf78Q9NZ63 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C9orf78Q9NZ63 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C9orf78Q9NZ63 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C9orf78Q9NZ63 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C9orf78Q9NZ63 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C9orf78Q9NZ63 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C9orf78Q9NZ63 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C9orf78Q9NZ63 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
C9orf78Q9NZ63 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C9orf78Q9NZ63 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C9orf78Q9NZ63 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C9orf78Q9NZ63 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C9orf78Q9NZ63 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C9orf78Q9NZ63 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms